Cartera de Servicios

 

1.BIOPSIAS

 

SISTEMA: APARATO DIGESTIVO

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Ampolla de Vater

122657005

104012

Biopsia por incisión de ampolla de Vater

122658000

106001

Extirpación de ampolla de Vater

Órgano: Ano

399731009

103010

Biopsia por escisión de ano

309265008

103003

Biopsia por incisión de ano

309267000

106001

Extirpación de ano

Órgano: Epiplon

11291002

106001

Biopsia por escisión de epiplon

309208007

104012

Biopsia por incisión de epiplon

309496001

106001

Omentectomía

Órgano: Esófago

71658001

104001

Biopsia endoscópica de esófago

122629003

104013

Biopsia por escisión de esófago (ej., polipectomía)

122628006

104012

Biopsia por incisión de esófago

122631007

107001

Esofagogastrectomía

3980006

106001

Esofaguectomía parcial

14072009

106001

Esofaguectomía total

426105008

106022

Resección endoscópica submucosa de esófago

Órgano: Estómago

10077008

104001

Biopsia endoscópica de estómago

122633005

104013

Biopsia por escisión de estómago (ej., polipectomía)

122632000

104012

Biopsia por incisión de estómago

122635003

106001

Gastrectomía parcial

122634004

106001

Gastrectomía total

438338008

107001

Gastrectomía total con linfadenectomía

425494001

106022

Resección endoscópica submucosa de estómago

Órgano: Hígado

439034006

105007

Biopsia por escisión de hígado

438659007

105007

Biopsia por incisión (en cuña) de hígado

309203003

105007

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de hígado

71273005

105007

Hepatectomía parcial (lobectomía o segmentectomía)

396481000

107003

Hepatectomía total

Órgano: Intestino delgado

39686002

104001

Biopsia endoscópica de intestino delgado

397053005

104013

Biopsia por escisión de intestino delgado (ej., polipectomía)

70871006

104012

Biopsia por incisión de intestino delgado

83857006

107001

Gastroduodenectomía total

90856004

106001

Resección total de intestino delgado

309220004

107001

Resección de intestino delgado con linfadenectomía

426889002

106022

Resección endoscópica submucosa de intestino delgado

397055003

106001

Resección parcial de intestino delgado

Órgano: Intestino grueso

421615004

103004

Biopsia de apéndice ileocecal

80050006

104001

Biopsia endoscópica de intestino grueso

122645001

104013

Biopsia por escisión de intestino grueso (ej., polipectomía)

122644002

104012

Biopsia por incisión de intestino grueso

122646000

106001

Resección abdominoperineal de intestino grueso

107944001

107001

Resección de intestino grueso con linfadenectomía (tumoral)

309200000

106001

Resección de recto (no tumoral)

309264007

106001

Resección de recto (resección anterior baja) (tumoral)

426066009

106022

Resección endoscópica submucosa de intestino grueso

309488006

106001

Resección parcial de intestino grueso (no tumoral)

122647009

106001

Resección total de intestino grueso (no tumoral)

Órgano: Mesenterio

432146008

104012

Biopsia de mesenterio

Órgano: Páncreas

415563002

105011

Biopsia por escisión de páncreas

122667000

105011

Biopsia por incisión de páncreas

309206006

105011

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de pancreas

122661004

106001

Pancreatectomía parcial

122665008

107001

Pancreatectomía Whipple

Órgano: Peritoneo

120177005

106001

Biopsia por escisión de peritoneo

309207002

103017

Biopsia por incisión de peritoneo (ej., saco herniario)

Órgano: Retroperitoneo

438803004

105012

Biopsia de retroperitoneo

Órgano: Vesícula biliar

369616003

104012

Biopsia por incisión de vesícula biliar

258492001

103019

Cálculo biliar

309205005

103019

Pieza de vesícula biliar

369617007

105007

Pieza de vesícula biliar y hepatectomía parcial

Órgano: Vía biliar

309493009

106021

Biopsia por incisión de vía biliar

397483006

106001

Extirpación de vía biliar

 

 

SISTEMA: CABEZA Y CUELLO

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Amígdala

309192007

103002

Amigdalectomía

309191000

103002

Biopsia por incisión de amígdala

Órgano: Cavidad Oral

309188000

104012

Biopsia por escisión de mucosa oral

239349005

104012

Biopsia por escisión mandibular o maxilar

309185002

104012

Biopsia por incisión de mucosa oral

178422006

104012

Biopsia por incisión mandibular o maxilar

309186001

104012

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de cavidad oral

Órgano: Cávum

309180007

104012

Biopsia de cavum

Órgano: Diente

309187005

104012

Biopsia de diente

Órgano: Faringe

309193002

104012

Biopsia de faringe

Órgano: Fosa nasal

432608000

104012

Biopsia por incisión de fosa nasal

309179009

104012

Extirpación de pólipo nasal

Órgano: Glándula salival

234937001

105003

Biopsia por escisión de glándula salival mayor

433119005

104007

Biopsia por incisión de glándula salival mayor

56872007

104007

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de glándula salival

309190004

105003

Extirpación de glándula salival mayor

309549006

104007

Extirpación de glándula salival menor

309485009

105003

Extirpación de glándula sublingual

309486005

105003

Extirpación de glándula submaxilar

309484008

105003

Parotidectomía

Órgano: Labio

282368008

104012

Biopsia por escisión de labio

282367003

104012

Biopsia por incisión de labio

309483002

104012

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de labio

Órgano: Laringe

309182004

104012

Biopsia por incisión de laringe

309184003

105008

Cordectomía

66478002

107005

Laringectomía con vaciamiento ganglionar

309183009

106009

Laringectomía

53103008

106007

Linfadenectomía de cuello (vaciamiento funcional o radical)

Órgano: Lengua

359556005

104012

Biopsia por escisión de lengua

282365006

104012

Biopsia por incisión de lengua

Órgano: Oído

128162003

104012

Biopsia de oído (incluye colesteatoma)

Órgano: Senos nasales y paranasales

433860001

104012

Biopsia de senos nasales y paranasales

 

 

SISTEMA: DERMATOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Piel

396483002

104015

Afeitado de lesión tumoral (no inflamatorio)

119327009

103014

Biopsia de uña

308000002

105013

Biopsia escisional de linfoma

300037009

104015

Biopsia escisional de carcinoma

177281002

105013

Biopsia escisional de melanoma

312968005

105013

Biopsia escisional de nevus displásico

396355000

105013

Biopsia escisional de piezas orientadas (localizaciones anatómicas de riesgo alto – labios, nariz, periocular, etc. -)

309506005

103014

Biopsia escisional simple de lesión benigna (incluye sinus pilonidal)

282014007

106013

Biopsia por incisión (inflamatoria)

240977001

105013

Biopsia por incisión (linfoma)

309505009

104015

Biopsia por incisión (tumoral)

129173004

106013

Cilindro alopecia (secciones horizontales y verticales -caso completo-)

309071005

104015

Cilindro de biopsia de piel genital (pene)

309070006

104015

Cilindro de biopsia de piel genital (vulva)

240977001

105013

Cilindro de linfoma cutáneo

309504008

103014

Cilindro de piel (para lesión, no inflamatorio)

119325001

105013

Cilindro de piel para melanoma (habitualmente lentigo maligno)

309066003

106013

Cilindro piel inflamatoria

65139003

105013

Cirugía de Mohs intraoperatoria (pases adicionales)

397833007

105013

Cirugía de Mohs intraoperatoria (primer pase)

309067007

104015

Curetaje de lesión tumoral

309068002

103014

Enucleación de lesión cutánea (ej., quistes)

396354001

105013

Resección cutánea amplia

 

 

SISTEMA: ENDOCRINOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Paratiroides

309151003

105010

Biopsia por incisión de paratiroides

309153000

105010

Paratiroidectomia (1 glándula)

Órgano: Suprarrenal

309142006

105004

Biopsia por incisión de suprarrenal

396527000

105004

Suprarrenalectomía (neoplásica)

309143001

105004

Suprarrenalectomía (no neoplásica)

Órgano: Tiroides

309144007

105018

Biopsia por escisión de tiroides (nódulo tiroideo)

432984003

104012

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de tiroides

122732007

105018

Tiroidectomía parcial (lobectomía) (no neoplásica)

399622002

107013

Tiroidectomía subtotal o total (neoplásica)

237486002

107013

Tiroidectomía total con linfadenectomía

 

 

SISTEMA: GINECOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Cérvix

396273004

106003

Amputación de cérvix

16210491000119100

104005

Biopsia de endocérvix (legrado)

399713008

106003

Biopsia por conización de cérvix

309286008

104013

Biopsia por escisión de cérvix (ej., pólipo)

122698003

104005

Biopsia por incisión de cérvix

Órgano: Endometrio

309288009

104013

Biopsia por escisión de endometrio (ej., polipectomía)

122703009

104006

Biopsia por incisión de endometrio (legrado, aspiración)

258428005

103016

Producto de concepción (restos ovulares sin embrión)

Órgano: Feto o embrión

309502007

104016

Aborto (restos ovulares más embrión)

431234000

106014

Feto 6-12 semanas (disección compleja, fotografía, seriación, etc.)

Órgano: Ovario

309291009

105009

Biopsia de quiste ovárico

122709008

105009

Biopsia incisional de ovario

122710003

105009

Ooforectomía

236911001

107002

Resección de masa anejo uterino

116028008

105009

Salpingo-ooforectomía

Órgano: Placenta

309293007

107014

Biopsia de vellosidades coriales

258426009

105014

Membrana placentaria

119403008

105014

Placenta completa

Órgano: Trompa uterina

116248005

103021

Biopsia escisional de trompa uterina

122720008

103020

Comprobación de trompas uterinas

300897007

103021

Salpinguectomía total

Órgano: Útero

449727003

104009

Biopsia por escisión de útero (ej., miomectomía)

116235006

104012

Biopsia por incisión de útero

31797009

104012

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de útero

122696004

107002

Histerectomía radical con linfadenectomía

309501000

105019

Histerectomía simple

309500004

106019

Histerectomía y anexectomía unilateral

309287004

106019

Histerectomía y doble anexectomía

Órgano: Vagina

122692002

104012

Biopsia por escisión de vagina

122691009

104012

Biopsia por incisión de vagina

122693007

107002

Vaginectomía

Órgano: Vulva

369618002

103014

Biopsia por incisión de vulva

397130007

104015

Biopsia por escisión de vulva

397132004

107002

Vulvectomía parcial

397133009

107002

Vulvectomía total

397134003

107002

Vulvectomía total con linfadenectomía

 

 

SISTEMA: HEMATOLINFOIDE

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Bazo

433760005

105002

Biopsia de bazo

234319005

106002

Esplenectomía (linfoma)

309077009

105002

Esplenectomía (no linfoma)

Órgano: Ganglio linfático

307996001

106006

Biopsia por escisión de ganglio linfático

397436009

106006

Biopsia por escisión de ganglio linfático por linfoma

309079007

106006

Biopsia por incisión de ganglio linfático por linfoma

21911005

104012

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de ganglio linfático

29300007

106006

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de ganglio linfático por linfoma

441709004

106007

Ganglio centinela

373193000

190024

Ganglio centinela (molecular)

399649002

106007

Linfadenectomía regional

Órgano: Médula ósea

396999004

106011

Biopsia de médula ósea

 

 

SISTEMA: MAMA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Mama

395165008

104011

Ampliación de márgenes en mama

373102004

104010

Biopsia asistida por vacío (mamotomo, MIBB, Vacuflash)

309546004

104011

Biopsia por escisión de mama (ej., tumorectomía)

122739003

104011

Biopsia por incisión de mama

122737001

104010

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de mama

237406004

104011

Mamoplastia + cicatriz

122598006

106010

Mastectomía parcial (ej., cuadrantectomía)

122597001

107007

Mastectomía parcial y linfadenectomía

122595009

107007

Mastectomía total

16211731000119100

107007

Mastectomía total y linfadenectomía

 

 

SISTEMA: NEFROLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Riñón

438804005

106015

Biopsia de trasplante renal

309270001

105016

Biopsia por escisión de riñón

122672009

106016

Biopsia por incisión de riñón

122670001

106016

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de riñón

309497005

105016

Nefrectomía no neoplásica

309498000

107011

Nefrectomía parcial (neoplásica)

399741007

107011

Nefrectomía total (neoplásica)

 

 

SISTEMA: NEUROLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Cerebro

443498007

106017

Biopsia de cerebelo

399732002

107012

Biopsia con resección parcial de lesión

399614009

107012

Biopsia por escisión de cerebro

432139004

106017

Biopsia por incisión de cerebro

399728008

106017

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de cerebro (estereotaxia)

Órgano: Ganglio nervioso

430132004

103012

Biopsia de ganglio nervioso simpático (ej., comprobación)

Órgano: Glándula pineal

443241002

106017

Biopsia de glándula pineal

Órgano: Hipófisis

309154006

105006

Biopsia de hipófisis

Órgano: Médula espinal

231033000

106017

Biopsia de ganglio raquídeo

239875000

106017

Biopsia por escisión de médula espinal

6778001

106017

Biopsia por esterotaxia de médula espinal

Órgano: Meninges

51031005

106017

Biopsia por escisión de meninges

28304008

106017

Biopsia por incisión de meninges

359988009

106017

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de meninges

Órgano: Músculo esquelético

432058006

107006

Biopsia músculo esquelético

Órgano: Nervio

438542005

103012

Biopsia de nervio vago (ej., comprobación)

309129006

107006

Biopsia por incisión de nervio

Órgano: Tronco del encéfalo

450601006

106017

Biopsia de tronco del encéfalo

 

 

SISTEMA: OFTALMOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Conjuntiva

119401005

105005

Biopsia de conjuntiva benigno inflamatorio

447337004

105005

Biopsia de conjuntiva benigno no neoplásico ni inflamatorio

193845004

106020

Biopsia de conjuntiva escisión tumor maligno

287500007

106020

Biopsia de conjuntiva Mapeo (1 bote)

128160006

106020

Biopsia de conjuntiva tumor benigno

172399001

106020

Biopsia de conjuntiva tumor maligno

Órgano: Globo ocular

447403008

105005

Anillo corneal-escleral de donante

399451009

105005

Biopsia corio-retinal

128161005

105005

Biopsia de córnea

119400006

105005

Biopsia de córnea compleja

258601009

105005

Biopsia de lens

431232001

105005

Biopsia de órbita

231733009

105005

Biopsia de tejido trabecular

172132001

106020

Enucleación neoplásica de globo ocular

396928004

105005

Enucleación no neoplásica de globo ocular

373356002

106020

Evisceración de globo ocular

399443006

106020

Exenteración de globo ocular

128164002

106020

Resección local tumor intraocular

Órgano: Saco lacrimal

172299004

105005

Biopsia de saco lacrimal (benigna)

202568006

105005

Biopsia de saco lacrimal (inflamatoria)

201583003

106020

Biopsia de saco lacrimal (maligna)

 

 

SISTEMA: OSTEOARTICULAR

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Articulación

309110000

105001

Biopsia de bursa

309113003

105001

Biopsia de tendón

309107007

105001

Biopsia incisional de tendón

309126004

105001

Biopsia no quirúrgica de articulación

309127008

105001

Biopsia por escisión de articulación

309112008

105001

Biopsia por escisión de bursa

309121009

105001

Biopsia por escisión de sinovial

309108002

105001

Biopsia por escisión de tendón

178121006

105001

Biopsia por incisión de bursa

309122002

105001

Biopsia por incisión de sinovial

Órgano: Hueso

116014002

107004

Biopsia por escisión amplia de hueso (ej., tumor maligno)

178919002

104008

Biopsia por escisión simple de hueso (ej., exóstosis)

309105004

106008

Biopsia por incisión de hueso

72771008

106008

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de hueso

 

 

SISTEMA: PARTES BLANDAS

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Partes blandas

408654003

106005

Amputación de extremidad por isquemia

406080008

107004

Amputación de extremidad por neoplasia maligna

56361007

107008

Biopsia extirpación amplia partes blandas

440502004

105012

Biopsia por escisión de partes blandas

75016008

103013

Biopsia por incisión de partes blandas

309074002

105012

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de partes blandas

 

 

SISTEMA: RESPIRATORIO

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Bronquio

274318008

104002

Biopsia endoscópica de bronquio

87101000

104013

Biopsia por escisión de bronquio (ej., polipectomía)

309174004

104012

Biopsia por incisión de bronquio

119730004

107010

Resección de bronquio

Órgano: Mediastino

43508000

107010

Biopsia por escisión de mediastino

122613006

107010

Biopsia por incisión de mediastino (mediastinoscopia)

70117004

107010

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de mediastino

Órgano: Pleura

278294002

107010

Biopsia por escisión de pleura

122621000

107010

Biopsia por incisión de pleura (toracoscopia)

122617007

104012

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de pleura

127461003

107010

Pleurectomía o decorticación

Órgano: Pulmón

77648009

107015

Biopsia por escisión de pulmón

384746001

107010

Biopsia por incisión de pulmón (ej., cuña)

309173005

104012

Biopsia transbronquial de pulmón

43831007

104012

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de pulmón

122606006

107010

Lobectomía de pulmón

440472000

107010

Neumonectomía bilateral (trasplante)

122607002

107010

Neumonectomía total

122605005

107010

Resección segmentaria de pulmón

Órgano: Timo

48382001

107010

Biopsia por escisión de timo

399633004

107010

Biopsia por incisión de timo

396902002

107010

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de timo

43450002

107010

Timectomía

Órgano: Tráquea

307822008

104002

Biopsia endoscópica de tráquea

438352005

107010

Biopsia por escisión de tráquea (ej., tumorectomía)

309169007

104012

Biopsia por incisión de tráquea

40583006

107010

Resección de tráquea

 

 

SISTEMA: UROLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Cordón espermático

309139000

103006

Biopsia de conducto deferente (ej., comprobación)

52521008

105017

Biopsia por escisión de cordón espermático

433873002

104012

Biopsia por incisión de cordón espermático

Órgano: Cubiertas testiculares

431413009

103011

Biopsia de cubiertas testiculares

Órgano: Epidídimo

446106003

105017

Biopsia por escisión de epidídimo

431205006

104012

Biopsia por incisión de epidídimo

Órgano: Pene

80855002

106012

Amputación de pene

44511009

104012

Biopsia por escisión de pene

432142005

103014

Biopsia por incisión de pene

Órgano: Próstata

122724004

105015

Biopsia por enucleación de próstata (adenomectomía)

309134005

104014

Cilindro (punch, BAG, tru-cut) de próstata

122725003

107009

Prostatectomía radical

384820007

105015

Resección transuretral de próstata

Órgano: Testículo

29865007

105017

Biopsia por escisión de testículo

122730004

104012

Biopsia por incisión de testículo

122729009

104012

Cilindro (punch, BAG, tru -cut) de testículo

236334001

106018

Orquiectomía (neoplásica)

309138008

105017

Orquiectomía (no neoplásica)

Órgano: Uréter

33570008

104012

Biopsia por escisión de uréter

309271002

104003

Biopsia por incisión de uréter

399407000

105016

Ureterectomía

Órgano: Uretra

128174004

104003

Biopsia de uretra

Órgano: Vejiga

15491007

104012

Biopsia por escisión de vejiga

309273004

104003

Biopsia por incisión de vejiga

122686008

107009

Cistectomía parcial

396685001

107009

Cistectomía radical

122687004

107009

Cistectomía total

122688009

107009

Cistoprostatectomía radical

309274005

105020

Resección transuretral de vejiga

Órgano: Vesículas seminales

433854001

104012

Biopsia de vesículas seminales

 

 

SISTEMA: VASCULAR

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Arteria

309481000

103018

Biopsia de arteria temporal

309479002

103018

Biopsia de contenido de arteria (ej., trombo, placa ateroma)

211601002

103018

Biopsia por escisión de arteria (ej., aneurisma)

Órgano: Corazón

119378002

106004

Biopsia de endocardio

119377007

106004

Biopsia de miocardio

434250007

106004

Biopsia de pericardio

258542004

103018

Biopsia de válvula cardiaca (nativa o prótesis)

122624008

106004

Biopsia por escisión de corazón

122625009

106004

Biopsia por incisión de corazón

32413006

107010

Corazón (trasplante)

Órgano: Vena

432061007

103018

Biopsia de vena

 

2.CITOLOGÍAS

 

SISTEMA: APARATO DIGESTIVO

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Ampolla de Vater

116155002

102002

Citología de ampolla de Vater

119289007

102005

PAAF de ampolla de Vater

Órgano: Ano

16216371000119100

102002

Citología de ano

110963007

190022

Citología de ano para determinación primaria molecular de HPV

442808001

102005

PAAF de ano

Órgano: Epiplon

433309007

102002

Citología de epiplon (impronta)

17444001

102005

PAAF de epiplon

Órgano: Esófago

110962002

102002

Citología de esófago

447359002

102005

PAAF de esófago

Órgano: Estómago

110936006

102002

Citología de estómago

432384008

102005

PAAF de estómago

446012006

102005

PAAF guiada por ecoendoscopia de estómago (EUS)

Órgano: Hígado

309204009

102002

Citología de hígado (impronta)

433116003

102005

PAAF de hígado

Órgano: Intestino delgado

110954005

102002

Citología de intestino delgado

432135005

102005

PAAF de intestino delgado

Órgano: Intestino grueso

116158000

102002

Citología de intestino grueso

432864003

102005

PAAF de intestino grueso

Órgano: Líquido ascítico

431771004

102002

Citología de líquido ascítico

Órgano: Mama

110899003

102002

Citología de piel de pezón de mama

430309006

102002

Citología de secreción pezón de mama

309055005

102002

Citología de líquido procedente de mama

309548003

102002

Citología de conducto mamario

309057002

102002

Citología de mama (impronta)

309061008

102006

PAAF de mama

Órgano: Mesenterio

433322004

102002

Citología de mesenterio (impronta)

434140003

102005

PAAF de mesenterio

Órgano: Páncreas

119343002

102002

Citología de páncreas

110929005

102002

Citología de páncreas (impronta)

431406009

102005

PAAF de páncreas

432543006

102005

PAAF guiada por ecoendoscopia de páncreas (EUS)

Órgano: Peritoneo

168139001

102002

Citología de líquido de lavado peritoneal o Douglas

110944006

102002

Citología de pared de peritoneo (impronta)

432982004

102005

PAAF de peritoneo

Órgano: Retroperitoneo

609063002

102002

Citología de retroperitoneo (impronta)

433118002

102005

PAAF de retroperitoneo

Órgano: Vesícula biliar

110926003

102002

Citología de vesícula biliar

431884001

102005

PAAF de vesícula biliar

Órgano: Vía biliar

110928002

102002

Citología de vía biliar (pared)

119341000

102002

Citología de contenido de vía biliar

432098008

102005

PAAF de vía biliar (pared)

709420008

102005

PAAF guiada por ecoendoscopia de vía biliar (EUS)

 

 

SISTEMA: CABEZA Y CUELLO

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Amígdala palatina

472867001

102002

Citología de amígdala palatina

430222001

102002

Citología de amígdala palatina (impronta)

Órgano: Boca

418932006

102002

Citología de boca

258564008

102002

Citología para corpúsculo de Barr

110925004

102002

Citología de boca (impronta)

432607005

102006

PAAF de boca

Órgano: Cabeza y cuello

431886004

102006

PAAF de lesión en cuello

710240002

102006

PAAF con control ecográfico de cuello

Órgano: Cavum

258500001

102002

Citología de cávum

110905003

102002

Citología de cávum (impronta)

Órgano: Faringe

472881004

102002

Citología de faringe

110934009

102002

Citología de faringe (impronta)

434406008

102006

PAAF de glándulas salivales

Órgano: Fosa nasal

110903005

102002

Citología de fosa nasal

430245007

102002

Citología de fosa nasal (impronta)

433859006

102006

PAAF de fosa nasal

Órgano: Glándula salival

110930000

102002

Citología de glándulas salivales

441695007

102006

PAAF de glándula parótida

441749007

102006

PAAF de glándula submaxilar

441876003

102006

PAAF de glándula sublingual

Órgano: Labio

472891005

102002

Citología de labio

431058008

102002

Citología de labio (impronta)

433115004

102006

PAAF de labio

Órgano: Laringe

472888005

102002

Citología de laringe

110908001

102002

Citología de laringe (impronta)

432865002

102005

PAAF de laringe

Órgano: Lengua

430249001

102002

Citología de lengua

309890001

102002

Citología de lengua (impronta)

432985002

102006

PAAF de lengua

Órgano: Oído

309166000

102002

Citología de oído

430241003

102002

Citología de oído (impronta)

434249007

102006

PAAF de oído

Órgano: Senos nasales y paranasales

472901003

102002

Citología de senos nasales y paranasales

110904004

102002

Citología de senos nasales y paranasales (impronta)

433861002

102006

PAAF de senos nasales y paranasales

 

 

SISTEMA: DERMATOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Piel

258503004

102002

Citología de raspado o frotis de piel

309075001

102002

Citología contenido de lesión de piel

110893002

102002

Citología de piel (impronta)

432134009

102006

PAAF de piel

 

 

SISTEMA: ENDOCRINOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Paratiroides

309149002

102002

Citología de paratiroides (impronta)

432141003

102005

PAAF de paratiroides

Órgano: Suprarrenal

372268003

102002

Citología de suprarrenal (impronta)

396525008

102005

PAAF de suprarrenal

Órgano: Tiroides

116162006

102002

Citología de tiroides (impronta)

116161004

102005

PAAF de tiroides

442865000

102005

PAAF con control ecográfico de tiroides

 

 

SISTEMA: GINECOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Cérvix

110949001

102001

Citología de ectocérvix. Toma única

110951002

102001

Citología de endocérvix. Toma única

276446009

102001

Citología de cérvix. Doble toma (ecto y endocérvix)

110953004

102001

Citología cervicovaginal. Doble toma

430387006

102001

Citología cervicovaginal. Triple toma

35904009

190022

Citología de cérvix para determinación primaria molecular de HPV

Órgano: Endometrio

110955006

102001

Citología de endometrio

Órgano: Feto

110968003

102002

Citología de feto (impronta)

Órgano: Ovario

116213003

102002

Citología de ovario (impronta, contenido)

431405008

102005

PAAF de ovario

Órgano: Placenta

110959000

102002

Citología de placenta (impronta)

Órgano: Trompa uterina

110957003

102002

Citología de trompa uterina (impronta)

431233006

102005

PAAF de trompa uterina

Órgano: Útero

127479004

102002

Citología de útero (impronta)

432060008

102005

PAAF de útero

Órgano: Vagina

110947004

102001

Citología de vagina

312494007

102001

Citología de cúpula vaginal

Órgano: Vulva

110945007

102001

Citología de vulva

432136006

102006

PAAF de vulva

 

 

SISTEMA: HEMATOLINFOIDE

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Bazo

609026006

102002

Citología de bazo (impronta)

432383002

102005

PAAF de bazo

Órgano: Ganglio linfático

110898006

102002

Citología de ganglio linfático homogeneizado

258488008

102002

Citología de ganglio linfático (impronta)

609032001

102002

Citología de ganglio centinela (impronta)

432382007

102006

PAAF de ganglio linfático

702556008

102005

PAAF guiada por ecoendoscopia de ganglio linfático (EUS)

Órgano: Médula ósea

110897001

102002

Citología de médula ósea

Órgano: Sangre periférica

122551003

102002

Citología de sangre periférica

 

 

SISTEMA: NEUROLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Cerebro

16210851000119100

102002

Citología de cerebelo (impronta)

609023003

102002

Citología de cerebro (impronta)

Órgano: Ganglio nervioso

433799002

102002

Citología de ganglio simpático o parasimpático (impronta)

Órgano: Glándula pineal

446070006

102002

Citología de glándula pineal (impronta)

Órgano: Hipófisis

171958003

102002

Citología de hipófisis (impronta)

432983009

102005

PAAF de hipófisis

Órgano: Líquido cefalorraquídeo

110969006

102002

Citología de líquido cefalorraquídeo (LCR)

Órgano: Médula espinal

430221008

102002

Citología de médula espinal (impronta)

Órgano: Meninges

430157009

102002

Citología de meninges (impronta)

287510003

102005

PAAF de meninges

Órgano: Músculo esquelético

110900008

102002

Citología de músculo esquelético (impronta)

Órgano: Nervio

430236006

102002

Citología de nervio (impronta)

Órgano: Tronco del encéfalo

427599009

102002

Citología de tronco de encéfalo (impronta)

 

 

SISTEMA: OFTALMOLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Conjuntiva

258498002

102002

Citología de conjuntiva

Órgano: Globo ocular

258485006

102002

Citología de córnea

430117006

102002

Citología de globo ocular (impronta)

432981006

102006

PAAF de ojo

Órgano: Párpado

287502004

102002

Citología de párpado

 

 

SISTEMA: OSTEOARTICULAR

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Articulación

430312009

102002

Citología líquido sinovial o articular

258448003

102002

Citología de líquido de bursa

309125000

102002

Citología de articulación (impronta)

432419006

102006

PAAF de articulación

Órgano: Hueso

110901007

102002

Citología de hueso (impronta)

431404007

102005

PAAF de hueso

 

 

SISTEMA: PARTES BLANDAS

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Partes blandas

309072003

102002

Citología de partes blandas (impronta)

441810001

102005

PAAF de partes blandas

 

 

SISTEMA: RESPIRATORIO

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Bronquio

110912007

102002

Citología de cepillado bronquial

441903006

102002

Citología de aspirado bronquial (BAS)

122609004

102002

Citología de lavado broncoalveolar (BAL)

432140002

102005

PAAF de bronquio

Órgano: Esputo

430310001

102002

Citología de esputo

Órgano: Líquido pleural

430408004

102002

Citología de líquido pleural

Órgano: Mediastino

433326001

102002

Citología de mediastino (impronta)

432144006

102005

PAAF de mediastino

447793000

102005

PAAF guiada por ecobroncoscopia de mediastino (EBUS)

Órgano: Pleura

110913002

102002

Citología de pleura (impronta)

122618002

102005

PAAF de pleura

Órgano: Pulmón

258480001

102002

Citología de punción transtraqueal

446299006

102002

Citología de punción transbronquial

309177006

102002

Citología de pulmón (impronta)

122614000

102005

PAAF de pulmón

448452009

102005

PAAF guiada por ecobroncoscopia de pulmón (EBUS)

Órgano: Timo

396896007

102002

Citología de timo (impronta)

396899000

102005

PAAF de timo

Órgano: Tráquea

110920009

102002

Citología de tráquea

431235004

102005

PAAF de tráquea

 

 

SISTEMA: UROLOGÍA

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Cordón espermático

431696005

102005

PAAF de cordón espermático

430234009

102002

Citología de cordón espermático (impronta)

Órgano: Epidídimo

732975005

102002

Citología de epidídimo

110941003

102002

Citología de epidídimo (impronta)

432980007

102005

PAAF de epidídimo

Órgano: Líquido espermático

119347001

102002

Citología de semen o líquido espermático

Órgano: Orina

430318008

102002

Citología de orina espontánea

447589008

102002

Citología de orina instrumentalizada (catéter, lavado vesical)

444937002

102002

Citología de orina de uréter

Órgano: Pelvis renal

110943000

102002

Citología de pelvis renal

Órgano: Pene

258510005

102002

Citología de pene

110931001

102002

Citología de pene (impronta)

432143000

102005

PAAF de pene

Órgano: Próstata

110933003

102002

Citología de próstata (impronta)

441884004

102005

PAAF de próstata

Órgano: Riñón

122671002

102005

PAAF de riñón

110948009

102002

Citología de riñón (impronta)

Órgano: Seminal

609311002

102002

Citología de vesícula seminal (impronta)

Órgano: Testículo

110935005

102002

Citología de testículo (impronta)

441710009

102006

PAAF de testículo

Órgano: Uréter

110960005

102002

Citología de uréter

609028007

102002

Citología de uréter (impronta)

432420000

102005

PAAF de uréter

Órgano: Uretra

258530009

102002

Citología de uretra

110965000

102002

Citología de uretra (impronta)

433120004

102005

PAAF de uretra

Órgano: Vejiga

110950001

102002

Citología de vejiga (impronta)

432099000

102005

PAAF de vejiga

Órgano: Vesículas seminales

432057001

102005

PAAF de vesícula seminal

110937002

102002

Citología de vesículas seminales

 

 

SISTEMA: VASCULAR

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Arteria

432097003

102002

Citología de arteria (impronta)

274373006

102002

PAAF de arteria

Órgano: Corazón

116157005

102002

Citología de corazón (impronta)

122626005

102002

PAAF de corazón

Órgano: Líquido pericárdico

430379005

102002

Citología de líquido pericárdico

Órgano: Vena

309480004

102002

Citología de vena (impronta)

233463008

102002

PAAF de vena

 

3.AUTOPSIAS

 

SISTEMA: MÚLTIPLES SISTEMAS

SNOMED

Código SAS

Descripción

Órgano: Múltiples órganos

56417000

101002

Autopsia adulto completa (con o sin médula espinal)

74348008

101001

Autopsia adulto limitada (sin SNC)

47847005

101005

Autopsia adulto sólo SNC

386409003

101005

Autopsia SNC biobanco

57438004

101005

Autopsia parcial (tórax o abdomen)

50333006

106014

Autopsia feto (desde 12 semanas hasta 22 semanas de
gestación y/o 500 g)

16361008

101004

Autopsia perinatal (desde 22 semanas de gestación y/o
500g hasta 28 días)

41770000

101006

Autopsia postnatal (desde 28 días de vida hasta 1 año de
vida)

430339001

101006

Autopsia pediátrica (desde 1 año de vida hasta 14 años)

90864005

101003

Autopsia de alto riesgo de contaminación biológica (priones)

 

4.TÉCNICAS

 

SNOMED

Código SAS

Descripción

27204007

19001

Biopsia o citología intraoperatoria convencional

49052008

190002

Biopsia o citología intraoperatoria en horario no habitual

444598000

190002

Biopsia intraoperatoria de evaluación pretrasplante

104210008

190003

Hematoxilina-eosina automatizada

48635004

102006

PAAF realizada por patólogo

442787002

102005

PAAF con control de imagen con presencia de patólogo

53767003

102006

PAAF guiada por endoscopia

444945007

102007

PAAF guiada por ecografía

442973008

102008

PAAF guiada por TAC

16559321000119100

102009

PAAF de abdomen guiada por TAC

16551191000119104

102010

PAAF de tórax guiada por TAC

432337008

102012

PAAF de mama guiada por ecografía

116334007

102013

PAAF de mama guiada por esterotaxia

417036008

190019

Citología en medio líquido

24214008

190003

Técnica histoquímica convencional

86171007

190004

Técnica histoenzimológica

406867009

190005

Técnica inmunofluorescencia (directa o indirecta)

117617002

190006

Técnicas inmunohistoquímicas

73512001

190007

Microscopía electrónica

426329006

190018

FISH (Hibridación «in situ» fluorescente)

429532007

190013

Hibridación «in situ» cromogénica

60287000

190014

Fotografía macro o microscópica

117358004

190014

Preparación digital (escaneado completo de cada laminilla)

24587005

190011

Análisis automatizado de imagen

726007

190015

Consulta de casos externos

308364004

190016

Muestra para Biobanco

709491003

190016

Muestra para ensayo clínico

59000001

190015

Muestra enviada a segunda opinión

113041004

190015

Muestra enviada para realización de estudios adicionales

104166004

190020

Extracción de ácidos nucleicos (ADN/ARN) a partir de
material fresco o parafinado

9718006

190021

PCR convencional

443686007

190024

PCR cuantitativa o a tiempo real y otras técnicas de amplificación (OSNA)

443968007

190025

Secuenciación masiva

117040002

190025

Secuenciación mutaciones conocidas

444660008

190024

Perfil de expresión génica (plataformas)

443982007

190024

Biopsia líquida

64444005

190012

Citometría de flujo

312948004

190011

Cariotipo de tumor sólido

108257001

190016

Otras técnicas o procedimientos básicos

9911007

190017

Biopsia con aguja gruesa (BAG) de lesión palpable

444704008

190018

Biopsia con aguja gruesa (BAG) guiada por ecografía

399710006

190019

Biopsia con aguja gruesa (BAG) guiada por esterotaxia

444796003

190020

Biopsia con aguja gruesa (BAG) guiada por TAC

719573001

190021

Biopsia asistida por vacío (BAV) guiada por esterotaxia

432157003

190022

Biopsia asistida por vacío (BAV) guiada por ecografía

 

5.NEUROPATOLOGÍA

 

TÉCNICAS NEUROPATOLOGÍA

Alfa-beta cristalina

Alfa-distroglicano

ATPasas

Beta-amiloide

Calpaina (A y B)

Caveolina-3

Colágeno VI

COX-SDH

Desmina

Disferlina

Distrofinas (CT, RD, NT)

Emerina

Espectrina

Fosfatasa ácida

Fosfofructokinasa

Fosforilasa

H/E

Holzer

Luxol Fast-Blue

MAC

MAD

Menadiona

Merosina

MHC-I

Miosina (Fast, Slow, Neo)

Miotilina

NADH

Nilss-Cresil Violeta

Oil Red-O

PAS

PrP

Sarcoglicanos (alfa, beta, gamma y delta)

SDH

Sevier-Munger

Tau

TDP-43

Tricrómico

Ubiquitina

Utrofina

ZN/FITE

 

6.HISTOQUÍMICA

 

TÉCNICAS HISTOQUÍMICAS

Azul alcian

Azul de toluidina

Fibras elásticas

Fite Faraco

Giemsa

Giemsa eosinofilos

Gram

H/E Fosfotungstica

Hierro (azul de Perls)

Luxol fast blue

Masson Fontana

PAS

PAS – Azul alcian

PAS diastasa

Plata metenamina Grocott

Plata metenamina Jones

Reticulina

Rojo congo con pretratamiento de permanganato potásico

Rojo congo sin pretratamiento de permanganato potásico

Rojo oleoso

Sevier Munger

Sudan

Tricrómico de Gomori

Tricrómico de Masson (verde o azul)

Von Kossa

Warthin Starry

Yasue

Ziehl Neelsen

 

7.INMUNOHISTOQUÍMICA

 

TÉCNICAS INMUNOHISTOQUÍMICAS

A1 antitripsina

ACTH

AFP

Alfa-sinucleína

ALK (D5F3)

ALK (D5F3)

Amiloide A PRE KIT 4

AML

BCL-2

BCL-6

Beta-catenina

BRAF

C4D

Calcitonina

Caldesmon

Calponina-1

Calretinina

CD 10

CD 138

CD 15

CD 163

CD 1A

CD 20

CD 21

CD 22

CD 23

CD 25

CD 3

CD 30

CD 31

CD 34

CD 38

CD 4

CD 43

CD 45

CD 5

CD 56

CD 61

CD 68

CD 7

CD 79A

CD 8

CD 99

CD123 PRE KIT 101

CD19

CDX-2

CEA

Célula mesotelial (HMBE)

Ciclina D1

CK

CK 1,5

CK 19

CK 20

CK 5/6

CK 7

CK 8/18

C-KIT

CMV

C-MYC

Colágeno TYPE IV

Cromogranina A

D240-Podoplanina

Desmina

DOG-1

EBER

EBV

E-Cadherina

EMA

Enolasa PRE KIT 27

ERG

FACTOR VIII

FACTOR XIII

Fascina

Fibronectina

FLI-1 PRE KIT 517

FSH

Galactin-3

Gastrina

GATA-3

GFAP

GH

Glicoforina-1

Glipican-3

Glucagon

GLUT-1

Granzima B

HBC PRE KIT 511

HBM45

HBS

Hepatocyte

HER-2

HER-2 SISH

HGC (gonadotropina coriónica)

HHV-8

HVC PRE KIT 100

HVS

IDH-1 PRE-KIT 516

IgA

IgD

IgG

IgG4

IgM

Inhibina

INI-1

Insulina

Kappa

Kappa ISH

Ki-67

Lactógeno placentario (HPL)

Lambda

Labmda ISH

LH

Lisozima

Mamaglobina

MDM2 PRE KIT 64

Melan-A

Mieloperoxidasa

Miogenina (myf4)

MLH-1

MSH-2

MSH-6

MUC-4

MUM-1

Napsina

NEU-N

Neurofilamentos

OCT-2

OCT-4

P16

P27

P40

P53

P57

P63

PAN TRK

PAX 8

PAX5

PD-1

PDL-1

PLAP

PMS2

Pneumocystis PRE KIT 515

PRL (Prolactina)

Proteina glial fibrilar ácida

PSA

PTH

Racemasa (P504) PRE KIT 34

RCC

Receptor de andrógenos

Receptor de estrógenos

Receptor de progesterona

ROS 1

S100

SAT B2

Sinaptofisina

Somastotatina

SOX-10

SOX-11

STAT 6 PRE KIT 104

SV-40

TCR BETA F1

TDT

TFE-3

Tiroglobulina

TLE-1

Toxoplasma PRE KIT 512

Treponema PRE KIT 513

Triptasa

TSH

TTF1

Vimentina

WT1

 

8.PATOLOGÍA MOLECULAR

TÉCNICAS DE HIBRIDACIÓN FLUORESCENTE IN SITU

Se realizan estudios de alteraciones génicas y cromosómicas sobre núcleos en interfase como apoyo al diagnóstico anatomopatológico. Se procesan muestras tisulares fijadas en formol e incluidas en parafina, tejidos en fresco y material citológico. El método de análisis es la Hibridación In Situ gen/región específica según catálogo de las sondas.

El tiempo estimado para realizar las determinaciones a través de este método es, desde que se recibe la petición, de 7 a 14 días naturales para todas las lesiones salvo las melanocíticas, cuyo tiempo estimado es de 21 a 28 días naturales.

El laboratorio dispone de sondas para realizar los siguientes estudios:

 

ESTUDIO

SONDA

GEN

REGIÓN CROMOSÓMICA

Reordenamiento

LSI BreakApart

ALK

2p23

BCL2

18q21

BCL6

3q27

BCOR

Xp11

BRAF

7q34

CCND1

11q13

CIC

19q13

DDIT3 [CHOP]

12q13

ERG

21q22

ETV6

12p13

EWSR1

22q12

FOXO1

13q14

FUS

16p11

IGH

14q32.3

IRF4/DUSP22

6p25

JAZF1

7p15

MALT1

18q21

MYB

6q23.3

MYC

8q24

NCOA2

8q13

NR4A3

9q31

NUTM1

15q14

PDGFB

22q13.1

RELA

11q13.1

RET

10q11.21

ROS1

6q22.2

SS18 (SYT)

18q11.2

TFE3

Xp11.23

USP6

17p13.2

WWTR1

3q25.1

YWHAE

17p13.3

Fusión

Dual Color, Dual Fusion

API2/MALT1

IGH/BCL2

IGH/CCND1

IGH/MYC

Deleción

LSI Dual Color

ATM

11q22.3

CDKN2A

9q21

PTEN

10q23

TP53

17p13.1

1p36

11p15.5

19q13

22q11.12

Amplificación

LSI Dual Color

EGFR

7p11.2

ERBB2 (HER2)

17q12

MDM2

12q15

MDM4**

1q32

MET

7q31.2

MYC

8q24

MYCN

2p24.3

Melanoma

Multicolor Multiprobe

CCND1 / RREB1 / MYB / CEP6

11q13.2 / 6q23.3 / 6p25

 

ESTUDIO

SONDA

CROMOSOMA

Alteración numérica

LSI

CEP1

CEP2

CEP3

CEP8

CEP11

CEP13

CEP16

CEP17

CEP18

CEP21

CEP X/Y

 

TÉCNICAS DE REACCIÓN EN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR)

Se realizan estudios de mutaciones puntuales y reordenamientos génicos, análisis de inestabilidad de microsatélites y estudios de metilación sobre ácidos nucleicos extraídos alteraciones de muestras tisulares fijadas en formol e incluidas en parafina, tejidos en fresco y material citológico. El método de análisis es la PCR, tanto la convencional como otras de sus variantes según catálogo de biomarcadores.

El laboratorio realiza estudios de:

 

ESTUDIO

GEN

TIEMPO ESTIMADO DETERMINACIÓN (días naturales)

Reordenamiento clonal de los genes

IGH

7 a 14

TCRγ

7 a 14

TCRβ

7 a 14

Mutaciones puntuales de los genes

BRAF

7 a 14

CTNNB1*

21 a 28

EGFR

7 a 9

EGFR plasma

7 a 14

H3H3A

21 a 28

IDH1/2*

7 a 14

ITD BCOR*

21 a 28

KIT*

21 a 28

KRAS

7 a 14

NRAS

7 a 14

PDGFRA*

21 a 28

POLE*

21 a 28

TERT*

21 a 28

Inestabilidad de microsatélites**

21 a 28

Metilación MLH1

MLH1

28 a 42

Detección de la presencia de M. tuberculosis en muestras parafinadas***

14 a 21

 

PANELES DE SECUENCIACIÓN MASIVA

Se realizan estudios de secuenciación masiva dirigida empleando diferentes paneles de genes para la detección de variantes somáticas en tumores sólidos, principalmente pronósticas y predictivas de respuesta a tratamiento. Los paneles utilizados no cubren en su totalidad los genes indicados y/o todas las regiones intrónicas. Se procesan muestras tisulares fijadas en formol e incluidas en parafina, tejidos en fresco y material citológico, del que se extraen ácidos nucleicos para su estudio.

El tiempo estimado para realizar estas determinaciones es, desde que se recibe la petición, de 14 a 28 días naturales.

 

ESTUDIO

GEN

TIEMPO ESTIMADO DETERMINACIÓN (días naturales)

OncomineTM Solid Tumour DNA Kit

AKT1, ALK, BRAF, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB4, FBXW7, FGFR1, FGFR2, FGFR3, KRAS, MAP2K1, MET, NOTCH1, NRAS, PIK3CA, PTEN, SMAD4, STK11, TP53

14 a 28 días

OncomineTM Focus Assay*

Mutaciones puntuales

AKT1, ALK, AR, BRAF, CDK4, CTNNB1, DDR2, EGFR, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ESR1, FGFR2, FGFR3, GNA11, GNAQ, HRAS, IDH1, IDH2, JAK1, JAK2, JAK3, KIT, KRAS, MAP2K1, MAP2K2, MET, MTOR, NRAS, PDGFRA, PIK3CA, RAF1, RET, ROS1, SMO

CNV

ALK, AR, BRAF, CCND1, CDK4, CDK6, EGFR, ERBB2, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, KIT, KRAS, MET, MYC, MYCN, PDGFRA, PIK3CA

Fusiones

ABL1, AKT3, ALK, AXL, BRAF, EGFR, ERBB2, ERG, ETV1, ETV4, ETV5, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, NTRK1, NTRK2, NTRK3, PDGFRA, PPARG, RAF1, RET, ROS1

14 a 28 días

 

PERFIL DE EXPRESIÓN

La prueba Prosigna® de firma génica para el pronóstico del cáncer de mama es una prueba diagnóstica in vitro que utiliza el perfil de expresión génica de células encontradas en tejido con cáncer de mama para evaluar el riesgo de recurrencia a distancia en un paciente. La prueba mide el perfil de expresión génica de RNA total extraído de muestras tisulares fijadas en formol e incluidas en parafina. Los datos de expresión génica se estudian junto con variables clínicas para generar un subtipo (luminal A, luminal B, HER2 enriquecido o de tipo basal) y una puntuación que indica la probabilidad de recurrencia a distancia de la enfermedad.

El tiempo estimado para realizar esta determinación es, desde que se recibe la petición, de 5 a 14 días naturales.

 

ESTUDIO

GEN

TIEMPO ESTIMADO DETERMINACIÓN (días naturales)

Firma génica Prosigna*

Panel 50 genes NanoString

7 a 14 días

 

* Estudio acreditado bajo la norma UNE-EN ISO 15189:2013

** Estudio realizado temporalmente en la unidad de Enfermedades Infecciosas, Microbiología y Medicina Preventiva. Fuera del alcance del SGC del laboratorio

FusionPlex® Expanded Sarcoma Panel

En el laboratorio de Patología Molecular de los Sarcoma y Otros Tumores, situado en el Instituto de Biomedicina de Sevilla se realiza una librería de secuenciación masiva de ARN (RNA-seq) para la detección de genes de fusión patognomónicos y otras alteraciones genéticas en sarcomas (mutaciones puntuales accionables y de resistencia a fármacos dirigidos, indels, duplicaciones y repeticiones en tándem) como apoyo al diagnóstico diferencial y para la identificación de dianas accionables.

Las librerías se preparan a partir de ARN extraído de muestras de tejido fijado en formol e incluido en parafina, material fresco o congelado. Los reactivos incluyen una mezcla de oligonucleótidos específicos para 55 genes frecuentemente alterados en sarcomas de hueso, partes blandas y viscerales:

ALK, BCOR, BRAF, CAMTA, CIC, CSF1, CTNNB1, EGFR, EPC1, ERG , ESR1, EWSR, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FOS, FOSB, FOXO1, FUS, GLI1, HMGA2, JAZF1, MDM2, MEAF6, MET, MGEA5, MKL2, MYOD1, NCOA1, NCOA2, NR4A3, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUTM1, PAX3, PDGFB, PHF1, PLAG1, PRKCA, PRKCB, PRKCD, RAF1, RET, ROS1, SS18, STAT6, TAF15, TCF12, TFE3, TFG, USP6, VGLL2, YAP1, YWHAE

La secuenciación de las librerías se lleva a cabo en un equipo MiSeq (Illumina) y el análisis se realiza en la plataforma bioinformática Suite Analysis v6.0.3.2 (ArcherDX), usando el genoma de referencia GRCh37/hg19.

El tiempo estimado para realizar esta determinación es, desde que se recibe la petición, de 15 a 20 días laborales.

9.DONACIÓN DE MUESTRAS A BIOBANCO

Permite a los ciudadanos participar en proyectos de investigación biomédica, con la donación de muestras biológicas y datos clínicos asociados al nodo Biobanco HUVR-IBiS, perteneciente al Biobanco del Sistema Sanitario Público de Andalucía y la red nacional de biobancos, contribuyendo activamente en el desarrollo de los avances científicos.

El principal requisito para realizar una donación de muestras biológicas al Biobanco para su uso en investigación es la firma por parte del donante del consentimiento informado de biobanco (para un proyecto específico o para un área de investigación). La persona donante dará su consentimiento por escrito para la donación de sus muestras y datos, tras un proceso de información, cada vez que ejerza la donación. Además, podrá negarse a participar o retirar su consentimiento en cualquier momento, sin tener que explicar sus motivos y sin que ello repercuta en su asistencia médica.

Los donantes también pueden inscribirse en el Registro Andaluz de Donantes de Muestras para Investigación Biomédica. Se trata de una base de datos o registro en el que se recoge la información básica de identificación y salud (datos) de personas interesadas en participar de manera voluntaria en investigación.

La donación de muestras para investigación es un acto voluntario y altruista ya que no reporta beneficios económicos ni tampoco supone un coste a la persona donante.

La persona donante tiene derecho a ser informado de en qué investigaciones se utilizan sus muestras y del destino de la muestra al término de la investigación. No obstante, si en el transcurso de la investigación se obtuvieran datos que sí fueran clínicamente relevantes para la salud del donante y/o su familia, se le podrán comunicar siempre que ésta marque dicha opción en el consentimiento.

En cuanto a los proyectos de investigación para los que el biobanco ceda muestras y/o datos, contarán con los vistos buenos de los comités ético y científico como requisitos indispensables.

Cartera de servicios del nodo biobanco HUVR-IBiS:

 

CONCEPTO

PROCEDIMIENTO ESPECÍFICO DE TRANSFORMACIÓN DE MUESTRAS

PROVISION DE MUESTRAS EN FRESCO_SANGRE Y ÓRGANO (DONACION COMPLETA) (CAPTACION CIRCUITO 1)

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

PROVISION DE MUESTRAS EN FRESCO_TEJIDOS EN FRESCO (CAPTACION MEDIANTE CIRCUITO 2)

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

PROVISION SECCIÓN EN PORTAOBJETOS FIJADA (CAPTACION MEDIANTE CIRCUITO 2)

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

PROVISION SECCIÓN EN TUBO FIJADA (sección de 10 micras). CAPTACION MEDIANTE CIRCUITO 2

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

PROVISION SECCIÓN EN TUBO CONGELADA _sección de 20 micras (CAPTACION MEDIANTE CIRCUITO 2)

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

PROVISION SECCIÓN EN PORTAOBJETOS CONGELADA (CAPTACION MEDIANTE CIRCUITO 2)

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

PROVISIÓN SECCIÓN DE MATRIZ DE MUESTRAS (TMA)_50 MUESTRAS (CAPTACIÓN MEDIANTE CIRCUITO 2)

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

PROVISIÓN DE SUERO_500 ul (CAPTACIÓN MEDIANTE CIRCUITO 2)

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

PROVISIÓN DE PLASMA_500 ul (CAPTACIÓN MEDIANTE CIRCUITO 2)

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

PROVISIÓN DE ADN_1 microgramo (CAPTACIÓN MEDIANTE CIRCUITO 1)

EXTRACCIÓN Y CONTROL DE CALIDAD DE ADN

PROVISION DE MUESTRAS EN FRESCO_SANGRE. (POR MUESTRA) (CAPTACION CIRCUITO 1)

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

PROVISION DE TEJIDO CONGELADO EN OCT (BLOQUE COMPLETO)

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

PROVISIÓN DE DATOS CLÍNICOS, DIAGNÓSTICO DISPONIBLES en los SSII

NO PROCEDE

PROVISIÓN DE DATOS CLÍNICOS, DIAGNÓSTICO A RECOGER de los SSII asistenciales

NO PROCEDE

CONGELACIÓN DE TEJIDO O CÉLULAS CON CRIOPRESERVANTE

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

CONGELACIÓN DE TEJIDO O CÉLULAS SIN CRIOPRESERVANTE

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

INCLUSIÓN EN PARAFINA DE TEJIDO O CÉLULAS

ESTABILIZACIÓN Y TRATAMIENTO

SECCIONES EN TUBO CONGELADAS

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

SECCIONES EN TUBO FIJADAS

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

SECCIONES EN PORTAOBJETOS CONGELADAS

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

SECCIONES EN PORTAOBJETOS FIJADAS

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

CONSTRUCCIÓN DE UNA MATRIZ DE TEJIDOS (TMA)

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

TINCIÓN HISTOQUÍMICA

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

TINCIÓN INMUNOHISTOQUÍMICA

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

VALORACIÓN MORFOLÓGICA Y/O FENOTÍPICA MANUAL DE UNA MATRIZ DE TEJIDOS

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

VALORACIÓN MANUAL MORFOLÓGICA Y/O FENOTÍPICA DE SECCIÓN HISTOLÓGICA O CITOLÓGICA

CARACTERIZACIÓN FENOTÍPICA

CUSTODIA DE MUESTRAS -80ºC (COSTE ANUAL POR MUESTRA)

NO PROCEDE

CUSTODIA DE MUESTRAS -20ºC (COSTE ANUAL POR MUESTRA)

NO PROCEDE

CUSTODIA DE MUESTRAS 4ºC (COSTE ANUAL POR MUESTRA)

NO PROCEDE

REGISTRO DE MUESTRAS EN CUSTODIA

NO PROCEDE

 

10.TIEMPOS DE DEMORA

Todas las muestras biológicas requieren un procesamiento previo y un tiempo de estudio y análisis variable, en función del tipo y complejidad de la misma. En algunos casos, la valoración y diagnóstico son directos, mientras en otros se requiere la realización de técnicas complementarias con la consiguiente ampliación en el tiempo de demora del estudio.

Los avances en el área de la patología oncológica, así como en el resto de las áreas, han llevado a un empleo creciente de las muestras y estudios anatomopatológicos para obtener información pronóstica y predictiva de respuesta a diferentes tratamientos por medio de la determinación de biomarcadores, cuyo estudio implica la realización de técnicas complementarias complejas que pueden aumentar significativamente el tiempo de demora.

En términos globales el tiempo de respuesta estimado para una biopsia convencional es menor o igual a 10 días hábiles, comprendidos desde la fecha de registro hasta la de emisión del informe. Las citologías de cribado de cáncer de cérvix deben informarse en <30 días y las autopsias completas en <60 días si no requieren estudio del SNC.

A continuación, se detallan los tiempos de demora estimados y pactados en los acuerdos de gestión clínica de la UGC según estudio:

 

AUTOPSIA

Tiempo de demora estimado (días hábiles)

Autopsia Adulto

<60 días

Autopsia Infantil

<60 días

Autopsia fetal

<60 días

Autopsia Neurológica

<90 días

Autopsia Infecciosa o de especial riesgo

<90 días

CITOLOGÍAS

Tiempo de demora estimado (días hábiles)

Citología exfoliativa ginecológica

<30 días

Citología no ginecológica (líquidos esputos, etc.)

<10 días

Citología por PAAF no realizada por patólogo

<15 días

Citología PAAF de órganos profundos con control de imagen realizada por patólogo

<7 días

Citología por PAAF de órganos superficiales realizada por patólogo

<7 días

BIOPSIAS O PIEZA QUIRÚRGICA

Biopsias/Pieza Quirúrgica (GRUPO I)

Tiempo de demora estimado (días hábiles)

Reconocimiento de tejido normal (comprobación de bordes quirúrgicos, rodetes, etc.

<10 días

Amígdalas y adenoides

<10 días

Ano (fisura, fistula, pólipo fibroepitelial)

<10 días

Apéndice cecal

<10 días

Colesteatoma

<10 días

Conductos deferentes (comprobación)

<10 días

Dupuytren, contractura

<10 días

Ganglio simpático (comprobación)

<10 días

Ganglio (quiste sinovial)

<10 días

Hemorroides

<10 días

Hidrocele (saco)

<10 días

Nervios Periféricos (comprobación)

<10 días

Partes blandas (lipoma, desbridamiento)

<10 días

Piel (quistes, queratosis seborreica, etc.)

<10 días

Pilonidal, sinus

<10 días

Restos Ovulares

<10 días

Saco Herniario

<10 días

Vasos (varices, trombos, ateromas.), válvulas cardiacas, etc., sin patología compleja

<10 días

Vesícula biliar no tumoral

<10 días

Trompas de Falopio (comprobación)

<10 días

Trompa de Falopio (gestación ectópica)

<10 días

 

Biopsias/Pieza Quirúrgica (GRUPO II)

Tiempo de demora estimado (días hábiles)

Aparato digestivo: biopsia endoscópica

<10 días

Aparato respiratorio: biopsia endoscópica

<10 días

Aparato Urinario: biopsia endoscópica

<10 días

Branquial, quiste

<10 días

Cérvix: biopsia

<10 días

Endometrio: biopsia

<10 días

Glándula salival: biopsia

<10 días

Hueso, exóstosis

<10 días

Leiomioma uterino, miomectomía

<10 días

Mama: biopsia por punción

<10 días

Mama: nodulectomía (fibroadenoma…) o ampliación de márgenes

<10 días

Mucosas (otras): biopsia

<10 días

Piel: Patología tumoral común (carcinoma basocelular, carcinoma epidermoide, nevus, queratoacantoma, etc.)

<10 días

Polipeptomías de distintas localizaciones

<10 días

Próstata: biopsia por punción

<10 días

Restos Ovulares más embrión

<10 días

Biopsias/Pieza Quirúrgica (GRUPO III)

Tiempo de demora estimado (días hábiles)

Articulaciones: biopsia y sinovectomía

<10 días

Bazo no tumoral

<10 días

Glándula salival

<10 días

Glándulas suprarrenales

<10 días

Globo ocular: patología no tumoral biopsias oculares, córneas, etc.)

<10 días

Hipófisis

<10 días

Hígado: tumorectomía o hepatectomía parcial

<10 días

Laringe: cordectomía

<10 días

Ovario quístico no tumoral

<10 días

Paratiroides

<10 días

Páncreas: biopsia

<10 días

Partes blandas (excepto lipoma convencional): biopsia o tumorectomías simples

<10 días

Piel: Otras patologías tumorales (tumores anexiales, melanomas, enfermedad de Bowen etc.)

<10 días

Placenta

<10 días

Próstata, R.T.U. y prostatectomía por hiperplasia nodular (adenoma)

<10 días

Riñón no tumoral

<10 días

Testículo y anejos no tumorales

<10 días

Tiroides: tiroidectomía total o parcial por patología benigna (lobectomía por adenoma, tiroidectomía por bocio, etc.)

<10 días

Útero: histerectomía simple

<10 días

Vejiga: resección transuretral

<10 días

Pulmón: cuña o resección parcial por patología benigna

<10 días

Serosas: biopsias en cuña, decorticaciones, etc. (pleura, pericardio, peritoneo)

<10 días

Vascular: patología inflamatoria (en casos, válvulas, etc.)

<10 días

Biopsias/Pieza Quirúrgica (GRUPO IV)

Tiempo de demora estimado (días hábiles)

Aparato digestivo: pieza de resección en patologías benignas (segmentos de intestino, pancreatectomías, etc.)

<10 días

Bazo tumoral

<10 días

Cervix: conización

<10 días

Endomiocardio: biopsia

<10 días

Extremidades por isquemia

<10 días

Ganglio linfático

<10 días

Ganglio: vaciamiento, seriación de ganglio centinela

<10 días

Laringe: cordectomía

<10 días

Ovario quístico no tumoral

<10 días

Paratiroides

<10 días

Páncreas: biopsias

<10 días

Partes blandas (excepto lipoma convencional): biopsias o tumorectomías simples

<10 días

Piel: otras patologías tumorales (tumores anexiales, melanomas, enfermedad de Bowen, etc.)

<10 días

Placenta.

<10 días

Próstata, R.T.U. y prostatectomía por hiperplasia nodular (“adenoma”)

<10 días

Riñón no tumoral

<10 días

Testículo y anejos no tumorales

<10 días

Tiroides: tiroidectomía total o parcial por patología benigna (lobectomía por adenoma, tiroidectomía por bocio, etc.)

<10 días

Útero: histerectomía simple

<10 días

Vejiga: resección transuretral

<10 días

Pulmón: cuña o resección parcial por patología benigna

<10 días

Serosas: biopsias en cuña, decorticaciones, etc. (pleura, pericardio, peritoneo)

<10 días

Vascular: patología inflamatoria (en vasos, válvulas, etc.)

<10 días

Patología molecular

Tiempo de demora estimado

Ver apartado 8. Patología molecular del presente documento

11.CONSENTIMIENTO INFORMADO OBLIGATORIO

De entre las pruebas listadas en el presente documento, aquellas que requieren obligatoriamente consentimiento informado del paciente o representante legal para su realización son:

  • Autopsias

  • Biopsia o punción con aguja fina (PAAF)

  • Donación de muestras a Biobanco